MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 3970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015387	AGC	2	6	505172	505177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_015387	CTC	2	6	507675	507680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_015387	CAG	2	6	507683	507688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_015387	CTC	2	6	508424	508429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_015387	TCC	3	9	509184	509192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_015387	CAG	2	6	511720	511725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015387	CGA	2	6	511740	511745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015387	GAG	2	6	511768	511773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015387	CGA	2	6	511923	511928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_015387	CGG	2	6	511929	511934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_015387	GAG	2	6	511945	511950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015387	ACC	2	6	512012	512017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_015387	GTG	2	6	512036	512041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015387	AGC	2	6	512063	512068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_015387	AGC	2	6	512102	512107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_015387	GAG	2	6	512146	512151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015387	GCG	2	6	512171	512176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015387	CCAG	2	8	512202	512209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_015387	GCG	2	6	512210	512215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_015387	GC	3	6	512220	512225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_015387	ATG	2	6	512237	512242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015387	GAG	2	6	512440	512445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015387	CAG	2	6	512539	512544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_015387	GAG	2	6	512560	512565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015387	GAGGGC	2	12	512602	512613	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1026	NC_015387	CAT	2	6	512644	512649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015387	TGA	2	6	512664	512669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015387	CGG	2	6	512685	512690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_015387	CAT	2	6	512707	512712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015387	GGC	2	6	512749	512754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_015387	GAC	2	6	512794	512799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_015387	A	6	6	512838	512843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015387	TCA	2	6	515069	515074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_015387	T	6	6	515160	515165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015387	GAGG	2	8	515190	515197	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015387	CCGA	2	8	515224	515231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_015387	CAC	2	6	515299	515304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_015387	CCT	3	9	518233	518241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_015387	TTA	2	6	518298	518303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015387	TAG	2	6	518322	518327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015387	AAG	2	6	518345	518350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015387	CCAGG	2	10	518369	518378	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1043	NC_015387	CCG	2	6	519996	520001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_015387	G	6	6	520018	520023	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015387	CGA	2	6	521480	521485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015387	AGGA	2	8	521502	521509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015387	ATG	2	6	521982	521987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015387	CGA	2	6	522015	522020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_015387	GC	3	6	522030	522035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_015387	TCCT	2	8	527171	527178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_015387	G	6	6	527225	527230	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015387	CGGG	2	8	529289	529296	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_015387	CAT	2	6	530315	530320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_015387	AGG	2	6	530330	530335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015387	CAT	2	6	531304	531309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015387	GGA	2	6	531358	531363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015387	GC	3	6	532974	532979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_015387	GCC	2	6	539112	539117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_015387	TCCA	2	8	540458	540465	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_015387	CGG	2	6	540480	540485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015387	CACG	2	8	540497	540504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_015387	GAAC	2	8	540531	540538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_015387	TGG	2	6	540596	540601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015387	CG	4	8	540629	540636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_015387	GCG	2	6	541013	541018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015387	AGCG	2	8	544726	544733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_015387	G	6	6	544741	544746	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015387	GGA	2	6	544756	544761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015387	CTTTC	2	10	548292	548301	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1070	NC_015387	GGT	2	6	548307	548312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015387	C	6	6	549484	549489	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1072	NC_015387	G	6	6	549500	549505	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015387	CCT	2	6	550821	550826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_015387	CGGG	2	8	552607	552614	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_015387	CGT	2	6	552645	552650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015387	CCG	2	6	552678	552683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_015387	T	6	6	552715	552720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015387	CCT	2	6	552744	552749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_015387	GC	3	6	553178	553183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_015387	AC	3	6	555372	555377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_015387	CCG	2	6	555380	555385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_015387	TCA	2	6	556852	556857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_015387	T	6	6	557001	557006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015387	CCTT	2	8	557056	557063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_015387	GC	3	6	562336	562341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_015387	GCG	2	6	562355	562360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_015387	CTC	2	6	563720	563725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_015387	TTC	2	6	563747	563752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_015387	GC	3	6	564444	564449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_015387	AGG	2	6	565377	565382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015387	GGC	2	6	567144	567149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_015387	G	6	6	574240	574245	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015387	CGGAAA	2	12	574246	574257	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1094	NC_015387	GC	3	6	580121	580126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_015387	GCTT	2	8	580146	580153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_015387	GCG	2	6	586566	586571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_015387	GGCG	2	8	586575	586582	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_015387	A	6	6	586591	586596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015387	CCCGGC	2	12	586597	586608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_015387	CAA	2	6	587691	587696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_015387	GGAA	2	8	587741	587748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015387	AGG	2	6	590049	590054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015387	AGG	2	6	590105	590110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015387	GGCGG	2	10	591124	591133	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1105	NC_015387	GCC	2	6	591140	591145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_015387	CCGC	2	8	591146	591153	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1107	NC_015387	GTG	2	6	595043	595048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015387	GTG	2	6	595059	595064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015387	GCG	2	6	595080	595085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_015387	AGG	2	6	595098	595103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015387	AGA	2	6	595104	595109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015387	GGA	2	6	595126	595131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015387	GC	3	6	599132	599137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_015387	TACCC	2	10	599815	599824	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1115	NC_015387	CGC	2	6	599830	599835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_015387	GCG	2	6	599889	599894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_015387	G	6	6	602256	602261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015387	GC	4	8	604176	604183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_015387	GC	3	6	604203	604208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_015387	CCT	2	6	605410	605415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_015387	GGA	2	6	608969	608974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015387	CCTC	2	8	611134	611141	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1123	NC_015387	GATA	2	8	612039	612046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015387	G	6	6	612057	612062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015387	GCG	2	6	614850	614855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_015387	GC	3	6	614860	614865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_015387	TCT	2	6	615599	615604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015387	CA	3	6	615607	615612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_015387	TG	3	6	615614	615619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015387	AAG	2	6	615630	615635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015387	C	6	6	615650	615655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1132	NC_015387	ACC	2	6	615664	615669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_015387	G	6	6	615698	615703	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015387	GC	3	6	615717	615722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_015387	CCTC	2	8	616208	616215	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1136	NC_015387	TCC	2	6	616295	616300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_015387	CAT	2	6	617554	617559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1257	NC_015387	AGGGT	2	10	741482	741491	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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1265	NC_015387	A	6	6	748613	748618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_015387	GC	3	6	757148	757153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1272	NC_015387	GCTC	2	8	759608	759615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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